1860年于德国索伦霍芬附近被发现并由冯迈耶 Hermann von Meyer于1861年公开发表。此羽毛长约6厘米、宽1.1厘米，羽上有翮(羽干)，漂亮地将羽毛分隔成不对称的两个羽片，羽轴、羽枝和小羽枝都十分清楚。其结构与现代鸟类的初级飞羽十分相似，却是一支一亿五千万年前的羽毛化石。
伦敦标本
伦敦标本
1861年于德国索伦霍芬附近的朗恩艾特罕附近发现，同样的也是由 Hermann von Meyer所发表，并取名为Archaeopteryx(ancien wing古老、原始的翅膀) Lithographica(印版石)(所以正确的翻译应为始翼鸟，这个名字也比较不会那么令人直觉它就是所有鸟类的祖先)。当时达尔文的"物种演化"刚出版不久，演化论正是许多人探讨的议题，而始祖鸟这一兼具爬虫动物与鸟类特征的化石刚好可以填补这失落的环节。此标本原为当地一位医生哈柏廉 Carl Häberlein 所拥有(业余化石收藏家，有时会接受采石工人以化石来代替诊疗费，在1862年计已收藏1703件化石)，为女儿准备嫁妆而想将化石出售。虽有人努力想将此化石留在德国，列为官方收藏品，德国古生物学家并要求德皇威廉一世购下，以防国宝流入英国，但德皇并未响应，且因慕尼黑大学的动物学教授华格纳声明那并非一介于爬虫类与鸟之间的中间型生物，此一观点使得始祖鸟化石更是乏人问津。古生物学家们只好另想辨法，要求国会下禁制出境令，但在法例生效前，哈柏廉便以450英镑(连同其它化石共700镑，分两期支付，约等于当时赫胥黎年收入的六成)售与伦敦的 British Museum of Natural History ，由该院研究员华特豪斯授意，但因其主要兴趣是昆虫学，便由欧文 Richard Owen作专题研究并于1863年发表论文，而赫胥黎 Thomas Huxley 亦对此标本进行研究并于1863年发表论文。此标本现仍存于该博物馆。
柏林标本
柏林标本
1877年于布鲁门柏格附近发现，几星期内 Ernest Häberlein (医生的儿子)便以140马克向采石场经理购得。此标本比伦敦的更漂亮、完整(英国只得意了15年)，也是被现今视为典型的化石标本。后售与企业家西门子 Werner Siemens，随后他又以两万马克售予普鲁士文化部，而在柏林的 Humbolt Museum 保存至今。1884年曾由达姆斯 Wilhelm Dames 提出正式的描述报告。
马克斯柏格标本
马克斯柏格标本
1958年于朗恩艾特罕附近发现(同伦敦标本)。此标本支离破碎，羽毛痕迹也相当模糊。并在1959年由海勒 Heller 描述，之后在 Maxberg Museum 展出多年后，由其住在帕本海姆Pappenhein的所有人欧毕屈 Eduard Opitsch 保存而不再公开展示。于其所有人死后下落不明。
哈伦标本(又称特勒尔标本)
哈伦标本
1855年于芮登柏格附近发现，被荷兰哈伦的特勒尔博物馆收藏后，于1875年被 H. von Meyer 鉴定为翼手龙。后来才在1970年由奥斯壮 John Ostrom 发现标本上的羽毛印痕而重新鉴定为始祖鸟。现存于 Teyler Museum, Haarlem, holland。
艾希塔标本
艾希塔标本
1951年于沃克斯卓附近发现，原被误认为细颚龙，存于德国艾希塔侏罗博物馆 ，于1973年由其博物馆创办人迈尔 F. X. Mayr 予以纠正。并于1974年送往慕尼黑的 国立巴伐利亚古生物暨地史学馆藏地质学部门由威尔霍佛进行研究。此标本较小，但头部保存十分完整。现仍存于该博物馆。
